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研究人員發(fā)現(xiàn)鹿攜帶SARS-CoV-2變體，研究這種變體在人類中已經(jīng)滅絕

對(duì)SARS-CoV-2進(jìn)行采樣和測(cè)試的發(fā)現(xiàn)WTD人群的人口統(tǒng)計(jì)學(xué)。在紐約州（NY）狩獵第一季（2020年9月至12月，鹿攜n=2700）和第二季（2021 9月至十二月，研究n=3762）期間，發(fā)現(xiàn)從自由放養(yǎng)的鹿攜狩獵采集的WTD中采集咽后淋巴結(jié)（RPLN）樣本。（A）紐約州的研究抽樣分布和陽(yáng)性率。在第一季的發(fā)現(xiàn)17個(gè)樣本（0.6%）和第二季的583個(gè)樣本（21.1%）中檢測(cè)到SARS-CoV-2 RNA。（B）紐約州每個(gè)縣第1季和第2季SARS-CoV-2陽(yáng)性樣本的鹿攜比例。（C）紐約WTD SARS-CoV-2感染的研究高風(fēng)險(xiǎn)地區(qū)或熱點(diǎn)。對(duì)第二季的發(fā)現(xiàn)樣本進(jìn)行空間聚類分析（n=2762）。確定了19個(gè)空間簇（C1至C19），鹿攜其中包含在彼此相距10.6至55km的研究半徑內(nèi)采集的3至57個(gè)陽(yáng)性樣本。圖中突出了WTD中SARS-CoV-2感染高危的發(fā)現(xiàn)七個(gè)熱點(diǎn)（相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)[RR]>1.76）。（D）在第一季和第二季期間，鹿攜根據(jù)WTD的性別和年齡收集的樣本總數(shù)。動(dòng)物分為以下三個(gè)年齡組：小于1.5歲（小鹿）、≥1.5歲且小于2.5歲（一歲）和≥2.5歲（成年）。（E） SARS-CoV-2陽(yáng)性樣本數(shù)量——基于第一季和第二季W(wǎng)TD的性別和年齡。（F）在第一季和第二季期間，基于WTD性別和年齡的陽(yáng)性樣本比例。資料來(lái)源：《美國(guó)國(guó)家科學(xué)院院刊》（2023）。DOI:10.1073/pnas.2215067120
（神秘的地球uux.cn）據(jù)美國(guó)物理學(xué)家組織網(wǎng)（作者：Cornell University）：康奈爾大學(xué)的研究人員發(fā)現(xiàn)，北美數(shù)量最多的大型哺乳動(dòng)物白尾鹿體內(nèi)含有SARS-CoV-2變體，這種變體曾廣泛傳播，但在人類體內(nèi)已不再存在。
隨著科學(xué)家們不斷收集和分析新的數(shù)據(jù)，鹿是否能成為這些過(guò)時(shí)變種的長(zhǎng)期儲(chǔ)存庫(kù)仍然未知。
這項(xiàng)研究于1月31日發(fā)表在《美國(guó)國(guó)家科學(xué)院院刊》上，是迄今為止評(píng)估白尾鹿SARS-CoV-2流行率、遺傳多樣性和進(jìn)化的最全面研究之一。
康奈爾大學(xué)人口醫(yī)學(xué)和診斷科學(xué)副教授Diego Diel說(shuō)：“這項(xiàng)研究最引人注目的發(fā)現(xiàn)之一是在這一野生動(dòng)物種群中檢測(cè)到三種致癌物-α、γ和δ-的共同循環(huán)。”。
在大流行過(guò)程中，鹿通過(guò)與人類的持續(xù)接觸感染了SARS-CoV-2，可能來(lái)自狩獵、野生動(dòng)物康復(fù)、喂養(yǎng)野生動(dòng)物或通過(guò)廢水或水源。
Diel說(shuō)：“一種病毒在亞洲的人類身上出現(xiàn)，很可能是在從動(dòng)物庫(kù)溢出到人類體內(nèi)之后，顯然，或可能是在北美發(fā)現(xiàn)了一種新的野生動(dòng)物庫(kù)。”。
研究中使用的5700個(gè)樣本是在2020-22年間在紐約收集的。
當(dāng)研究人員將在鹿中發(fā)現(xiàn)的變體的基因組序列與從紐約各地的人類身上獲得的相同變體的序列進(jìn)行比較時(shí)，他們發(fā)現(xiàn)這些病毒在鹿中發(fā)生了變異，這表明這些變體可能已經(jīng)在鹿中傳播了好幾個(gè)月。例如，當(dāng)在鹿中檢測(cè)到α和γ變體時(shí)，沒(méi)有證據(jù)表明這些病毒株仍在人類中傳播。事實(shí)上，當(dāng)它們?cè)诼股砩媳话l(fā)現(xiàn)時(shí)，在紐約的人類身上已經(jīng)有四到六個(gè)月沒(méi)有發(fā)現(xiàn)這兩種變體。
迪爾說(shuō)：“當(dāng)我們將從白尾鹿中回收的病毒與人類序列進(jìn)行序列比較時(shí)，我們觀察到病毒基因組中有大量突變。”他補(bǔ)充說(shuō)，與人類序列相比，一些病毒有多達(dá)80個(gè)突變，這進(jìn)一步證明了病毒可能在鹿中傳播了一段時(shí)間。這些突變表明，這種病毒已經(jīng)適應(yīng)了鹿，可能使它們之間的傳播能力更強(qiáng)。
需要更多的研究來(lái)確認(rèn)這些變異是否會(huì)隨著時(shí)間的推移在鹿中消失，或者SARS-CoV-2是否有傳播到其他野生動(dòng)物（包括捕食者）的風(fēng)險(xiǎn)。
迪爾說(shuō)：“由于我們研究中獲得的證據(jù)，繼續(xù)監(jiān)測(cè)這些動(dòng)物種群中的病毒非常重要，以真正了解和跟蹤可能導(dǎo)致或有利于向人類和其他野生動(dòng)物傳播的變化。”。
據(jù)估計(jì)，美國(guó)有3000萬(wàn)只白尾鹿。Diel等人于2022年進(jìn)行的一項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)，在2021調(diào)查的五個(gè)州中，40%的白尾鹿體內(nèi)發(fā)現(xiàn)了SARS-CoV-2。

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