《自然》雜志：從超過100萬年的猛犸象標本中檢索到DNA
（神秘的地球uux.cn報道）據cnBeta：外媒CNET報道，2002年，從超當Love Dalén第一次作為博士生開始研究古代動物DNA時，過萬
他的猛犸一位同事建議研究旅鼠。“每個人都在研究猛犸象，象標”這位同事告訴Dalén，本中“這很有競爭力。檢索”多年來，自然雜志這些古老的從超長鼻動物一直吸引著公眾和科學家的想象力--當 Dalén機會研究著名的長毛猛犸象時，他無法抗拒。過萬他想了解為什么這些生物會滅絕。猛犸
但在周三，象標Dalén和其他21位科學家研究了長毛猛犸象時間線的本中另一端：它的起源。在發表在《自然》雜志上的檢索一篇具有歷史意義的論文中，該團隊宣布他們從超過100萬年的自然雜志猛犸象標本中檢索到了DNA--完成了迄今為止年代最為久遠的史前生物的基因測序工作。
“這是
一篇驚人的論文，”澳大利亞格里菲斯大學的古DNA研究人員Sally Wasef說。她并未參與這項研究。
該研究取得了兩個方面的突破。首先，該團隊能夠從牙齒樣本中分離出短小、降解的DNA片段，并通過最近測序和數據分析技術的改進獲得遺傳密碼。
為了對古老的DNA進行測序，該團隊檢查了幾十年前在西伯利亞永久凍土中出土的三只不同猛犸象的臼齒。“我們知道其中一些牙齒來自最早的長毛猛犸象，” Dalén說。他表示，團隊從俄羅斯的合作者那里“得到了這些牙齒的小塊根部”，這些用于研究的牙齒通常重達幾公斤。對于一只巨型猛犸象來說，由于西伯利亞高緯度地區存在的冰冷溫度，這些臼齒受到保護，不會退化。
DNA的降解給科學家們尋找的年代帶來了一個上限。隨著時間的推移，DNA會分解成細小的碎片，然后也會和很多其他來自環境的DNA混合在一起?！伴_始變得很難發現猛犸象DNA、細菌DNA、人類DNA和植物DNA之間的區別，”Dalén說。在大約150萬年后，它變得太過退化，科學家們無法將其拼湊起來。
在這項新的研究中，該團隊正處于極限運行狀態。利用高通量測序和先進的計算分析，該團隊以現代大象基因組為藍本，將三個標本的DNA拼接在一起。這也有助于對這些野獸的年齡進行測定。其中兩個被稱為Krestovka和Adycha的樣本，分別有165萬和134萬年的歷史。第三個更年輕的標本Chukochya，距今約87萬年。
DNA序列也帶來了第二個突破。研究小組能夠利用這三個樣本，評估一百萬年前猛犸象的進化和標本化。Krestovka的數據指出了一個全新的猛犸象血統，此前科學界并不了解。這對該團隊來說是個驚喜。
“我們以為回到100萬年左右的一切都會是長毛猛犸象的祖先，”Dalén指出。“事實證明，一百萬年前有兩種不同類型的猛犸象”在西伯利亞漫游。
該團隊無法獲得足夠的數據來真正說明Krestovka的血統是什么樣子的，但他們可以表明Krestovka并沒有對長毛象的起源做出貢獻。
相反，它很可能是在大約200萬年前從長毛猛犸象的祖先中分裂出來的，然后產生了哥倫布猛犸象--一個存在于氣候更溫暖的北美洲的物種。哥倫布猛犸象大約在150萬年前的某個時候到達了那里，所以時間線非常吻合。Krestovka和長毛猛犸象可能進行了雜交，產生了哥倫布猛犸象。研究小組的理由是，在這一過程中發生了這種雜交，但要了解哥倫布猛犸的起源還需要做更多的工作。
這兩項突破都將有助于進一步推進古基因組學，即研究已滅絕物種的古老DNA。
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（神秘的地球uux.cn報道）據中國科學報（袁柳）：動物的遺傳信息最長可以保存多久？100萬年！
2月17日，《自然》上線的一項研究報道，古生物學家在西伯利亞東北部的永久凍土層中提取并解析了3頭猛犸象的遺傳物質，它們分別來自于70萬年、100萬年和120萬年前。這些遺傳物質還揭示了猛犸象的譜系。其中一頭草原猛犸象是真猛犸象的直系祖先，還有一頭猛犸象遺骸是此前未發現的種類，很可能是北美猛犸象的祖先。
人們不僅對猛犸象起源有了新認識，對古DNA的研究也更進一步——在此之前，最古老的DNA測序紀錄是75萬年前，來自一匹馬的大腿骨。
生物體死亡后，染色體會成為碎片，碎片長度隨時間推移越來越短，直至降解。但在深層凍土中，遺傳信息降解速度變慢，古DNA保藏時間更持久。該研究中的猛犸象遺骸最早于上世紀70年代被俄羅斯古生物學家Andrei Sher發現。他與瑞典自然歷史博物館進化遺傳學家Love Dalén合作，嘗試從中提取有價值的信息。
他們從每頭猛犸象的牙齒中鉆取微量樣本（大小約等于一撮鹽），并從中提取包含上千乃至上億堿基對的DNA。面對已降解成數十億片段的遺傳信息，研究小組比對了已有的大象和猛犸象測序數據?！斑@有點像看著盒上的圖片拼拼圖?！盌alén表示。
根據遺骸發掘處巖石的磁場信息及周圍其他的嚙齒動物骸骨，研究者推算出3頭猛犸象遺骸的產生時間。將樣本的幾個基因和已知的遺傳特征關聯，研究者確認這些猛犸象在當時已經具備了適應極端寒冷氣候的能力，它們有厚實的毛皮和充足的脂肪堆積。
研究者還發現，3頭猛犸象的基因樣本不同于北美猛犸象和哥倫比亞猛犸象。其中第二古老的猛犸象遺骸有100萬年歷史，被認定來自草原猛犸象，即真猛犸象的直系祖先。最古老的猛犸象來自此前未知的“血統”，因為被發現于克列斯托夫卡而以這一村莊的名字命名。研究人員推斷，該類猛犸象約在150萬年前進入北美，之后與真猛犸象發生雜交，從而形成了北美大陸的獨特亞種——北美猛犸象。
這一系列發現大大增加了科學家對猛犸象的了解。此前，有研究者找到過真猛犸象和哥倫比亞猛犸象的雜交證據，該研究表明古DNA研究中也出現了猛犸象的雜交證據。
Dalén表示，突破百萬年的門檻，意味著古DNA研究者有望進一步探索其他哺乳動物的早期歷史?；凶罟爬系纳锓肿有畔⒖梢娪邙r鳥、犀牛等動物，它們蛋殼或牙齒中包含的蛋白質序列比DNA更易保存。而這些樣品往往來自于有人為殘留物的考古現場。
那么，人們有沒有可能從凍土中發現人類近親的遺傳信息呢？這一問題的答案目前還尚未找到。不過，凍土中的古DNA年限限制很容易確定?！?60萬年，這是永久凍土的極限。在那之前，地球太溫暖了?！盌alén說。
相關論文信息：https://doi.org/10.1038/s41586-021-03224-9
